衣原体是一类高度分化的严格细胞内寄生的原核细胞微生物,广泛分布于自然界，分离培养十分困难。衣原体具有能通过细菌滤器，没有肽聚糖，对干扰素敏感，专性活细胞内寄生，有独特的发育周期等生物学特性。入侵真核细胞后，衣原体在由细胞膜 围成的小泡内繁殖，这种含有衣原体的小泡即称为包含体（Inclusion body)，在衣原体感染的最初几个小时内，具有感染性的原体（Elementary body)发育成为具有繁殖能力的网状体（Reticulate body)，然后进行象细菌一样的二分裂繁殖。约在感染后20小时，网状体又分化成熟为具有感染性的原体，进入新一轮的感染循环。

    衣原体的分类（衣原体在微生物界、门、纲、目、科、属、种分类中的地位）：

细菌界                           沙眼生物变种

  衣原体目         沙眼衣原体     性病淋巴肉芽肿变种

    衣原体科       鹦鹉热衣原体   鼠生物变种

      衣原体属     肺炎衣原体

                  牲畜衣原体

在衣原体的四个种中，沙眼衣原体与肺炎衣原体与人类的关系最为密切，但它们对人的致病谱相差很大。

沙眼衣原体

沙眼生物变种的A、B、Ba、C血清型是引起致盲沙眼的主要原因，D、E、F、G、H、I、J、K血清型则可引起包涵体结膜炎、新生儿肺炎、同时也是非淋菌性尿 道炎的主要病原体。

性病淋巴肉芽肿变种衣原体在人的淋巴结内繁殖，引起性病淋巴肉芽肿。

鼠生物变种衣原体不感染人。

肺炎衣原体为重要的人畜共患病原体。人群感染衣原体十分普遍，一个人一生中至少感染一次，血清学证实50％～90％的成年人肺炎衣原体抗体阳性。肺炎衣原体除可引起人上呼吸道感染、肺炎等急性呼吸系统疾病外，其慢性感染还可以引起慢性咽炎、慢性支气管炎、哮喘、肺癌等疾病，且越来越多的证据表明其慢性感染与冠心病等动脉粥样硬化密切相关。

鹦鹉热衣原体引起禽类的腹泻或慢性感染。人与病禽接触可感染鹦鹉热衣原体，引起非典型性肺炎。

牲畜衣原体主要在羊、猪等牲畜中流行和致病，一般不对人致病。